Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTAP09496 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLTAP09496 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTAP09496 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTAP09496 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTAP09496 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTAP09496 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTAP09496 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms