Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB5P09067 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB5P09067 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms