Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AB1P08238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AB1P08238 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms