Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFKMP08237 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFKMP08237 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFKMP08237 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFKMP08237 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFKMP08237 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PFKMP08237 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFKMP08237 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFKMP08237 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKMP08237 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms