Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI1P08151 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI1P08151 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI1P08151 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI1P08151 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI1P08151 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI1P08151 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI1P08151 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI1P08151 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI1P08151 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI1P08151 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms