Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOP08100 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOP08100 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOP08100 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOP08100 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOP08100 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOP08100 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOP08100 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOP08100 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOP08100 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOP08100 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOP08100 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms