Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALB1P05937 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALB1P05937 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALB1P05937 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CALB1P05937 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALB1P05937 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALB1P05937 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALB1P05937 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms