Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYCNP04198 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYCNP04198 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCNP04198 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCNP04198 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCNP04198 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCNP04198 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYCNP04198 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYCNP04198 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYCNP04198 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCNP04198 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCNP04198 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCNP04198 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYCNP04198 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYCNP04198 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms