Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTNP04004 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTNP04004 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTNP04004 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTNP04004 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTNP04004 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTNP04004 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTNP04004 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTNP04004 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTNP04004 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTNP04004 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTNP04004 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTNP04004 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTNP04004 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTNP04004 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms