Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGAP02671 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGAP02671 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FGAP02671 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGAP02671 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGAP02671 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGAP02671 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGAP02671 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGAP02671 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FGAP02671 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGAP02671 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms