Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APBA3O96018 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APBA3O96018 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
APBA3O96018 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBA3O96018 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBA3O96018 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBA3O96018 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBA3O96018 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBA3O96018 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms