Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL1O95922 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms