Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX58O95786 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX58O95786 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX58O95786 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX58O95786 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX58O95786 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms