Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNTO95613 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNTO95613 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNTO95613 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNTO95613 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNTO95613 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNTO95613 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNTO95613 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNTO95613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNTO95613 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNTO95613 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNTO95613 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNTO95613 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNTO95613 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNTO95613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms