Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D2O95562 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms