Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF12O95522 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF12O95522 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms