Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX6O95503 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX6O95503 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX6O95503 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX6O95503 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX6O95503 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX6O95503 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX6O95503 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CBX6O95503 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX6O95503 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX6O95503 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX6O95503 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX6O95503 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms