Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPBO95292 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPBO95292 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPBO95292 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAPBO95292 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAPBO95292 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAPBO95292 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAPBO95292 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAPBO95292 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAPBO95292 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAPBO95292 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAPBO95292 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPBO95292 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms