Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM1O95202 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM1O95202 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETM1O95202 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LETM1O95202 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LETM1O95202 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LETM1O95202 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LETM1O95202 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETM1O95202 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms