Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN1O94985 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms