Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOO75962 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOO75962 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOO75962 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIOO75962 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOO75962 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOO75962 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOO75962 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIOO75962 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOO75962 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOO75962 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIOO75962 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms