Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLOT1O75955 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms