Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRMUO75648 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRMUO75648 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRMUO75648 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRMUO75648 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms