Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSDE1O75534 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms