Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH4O75427 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms