Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITX3O75364 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX3O75364 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX3O75364 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX3O75364 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms