Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPHN1O60890 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPHN1O60890 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms