Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUPR1O60356 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUPR1O60356 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms