Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms