Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLIN1O60240 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms