Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3O43889 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3O43889 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3O43889 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3O43889 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3O43889 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3O43889 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3O43889 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3O43889 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3O43889 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3O43889 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3O43889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms