Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms