Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN4O43707 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN4O43707 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms