Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MTSS1O43312 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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