Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRXO43186 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRXO43186 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRXO43186 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRXO43186 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRXO43186 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRXO43186 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRXO43186 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRXO43186 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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