Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms