Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRIT1O00522 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRIT1O00522 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRIT1O00522 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRIT1O00522 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRIT1O00522 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRIT1O00522 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms