Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
O00370 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
O00370 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
O00370 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
O00370 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
O00370 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
O00370 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
O00370 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms