Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX39AO00148 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX39AO00148 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39AO00148 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39AO00148 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39AO00148 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39AO00148 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39AO00148 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms