Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
J3KT08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
J3KT08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
J3KT08 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms