Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC188H7C350 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms