Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1W4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1W4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1W4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1W4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1W4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1W4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1W4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1W4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1W4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1W4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1W4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1W4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1W4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H7C1W4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H7C1W4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H7C1W4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H7C1W4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms