Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms