Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
E9PCH4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
E9PCH4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
E9PCH4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
E9PCH4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
E9PCH4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
E9PCH4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
E9PCH4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
E9PCH4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
E9PCH4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
E9PCH4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
E9PCH4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
E9PCH4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
E9PCH4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
E9PCH4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
E9PCH4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
E9PCH4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
E9PCH4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
E9PCH4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
E9PCH4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
E9PCH4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
E9PCH4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
E9PCH4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
E9PCH4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
E9PCH4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms