Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E9PBE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E9PBE3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E9PBE3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E9PBE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E9PBE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E9PBE3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms