Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT4C9JH25 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms