Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC69A6NI79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC69A6NI79 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms