Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPOPA6NHQ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPOPA6NHQ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms