Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6BA6NDN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6BA6NDN3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms