Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L4A6NCW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L4A6NCW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms